Updated 2019-06-26

mafft.pbs

#PBS -N testMAFFT
#PBS -l nodes=1:ppn=2
#PBS -l pmem=2gb
#PBS -l walltime=1:00
#PBS -q force-6
#PBS -j oe
#PBS -o testMAFFT.out

cd $PBS_O_WORKDIR
module load mafft/7.245

mafft-linsi example.fasta > example.aln